js6666金沙登录入口-官方入口成立于2004年9月，由js6666金沙登录入口-官方入口与中国科学院上海药物研究所合作共建。中国科学院上海药物研究所蒋华良院士任首任经理。

公司下设药物科学系、制药工程系、上海市化员工物学重点实验室、上海市新药设计重点实验室、制药工程与过程化学教育部工程研究中心、GMP研究中心以及药学实验教学中心等部门，研究内容涵盖了化学药物、基因药物、农药和制药工程四个领域。

公司依托js6666金沙登录入口-官方入口在化学工程、制药工程、生物工程等领域的传统优势，结合中国科学院上海药物研究所的创新药物研究实力，理工融合，在教学科研和团队建设中创特色学科，造精品专业，办名牌学院。学院以“良药苦口、忠言逆耳”为院训，积极进取、敢为人先、创制良药。

制药工程专业源于化学制药工学，是1953年建校初期开设的八大专业之一，隶属有机化工系，冯成湜任系主任。1977年全国恢复统一招生后，化学制药专业仍属有机化工系。1981年5月，更名为应用化学系， 1982年5月，再次更名为精细化工系，俞俊棠、张铸勇、黄德音任系主任。直至1992年，化学制药专业一直归属精细化工系，诸季瑜、沈若连、程铸生等先后任该系主任。

药物制剂专业设立于1993年，为适应当时经济体制转轨的形式，满足社会主义市场经济建设对紧缺人才的需求，学校再由华东化工学院更名为js6666金沙登录入口-官方入口的同时增设包括药物制剂等在内的6个专业。此后，化学制药和药物制剂同属制药工程专业、精细化工系，由孙容奇担任系主任。

1997年，成立制药工程学院，化学制药和药物制剂化分至该院。根据1998年教育部《1998年普通高校本科专业目录》，学校对本科专业再次进行整理，将化学制药更名为制药工程，药物制剂专业维持原名不变。同时期还设有制药工程与精细化工学院（1997.07-1999.01），它与制药工程学院的关系为“二块牌子、一套班子”，制药工程与精细化工学院下设制药工程系、药物化工研究所等，沈永嘉任制药工程系主任。

1999年，成立化学与制js6666金沙登录入口-官方入口，由原制药工程与精细化工学院、原理学院的化学类系所和原基础教育学院的各类化学类教研组组成。

2004年，为适应中国经济、社会的不断发展，对人才的需求，学校成立确定js6666金沙登录入口-官方入口，有蒋华良担任首任经理，下设药学、药物制剂等专业。

2006年，制药工程系正式从化学与制js6666金沙登录入口-官方入口划分到js6666金沙登录入口-官方入口，至此js6666金沙登录入口-官方入口初步具备现金的格局。